Q: Wie geht es Ihnen? A: Gut. Und Ihnen? "Ihnen" refers to the indirect object of the verb "gehen". So the dative case required. (Wem geht es gut?)
Q: Was haben Sie gestern gemacht? A: Ich habe gearbeitet. Und Sie? "Sie" refers to the subject of the verb "machen". So the the nominative case is required. (Wer hat etwas gemacht?)